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Revised taxon definition in Europea Cortinarius subg. Dermocybe based on phylogeny, chemotaxonomy, and morphology

Os pongo este artículo en inglés de Huymann, L.R., Hannecker, A., Giovanni, T. et al. publicado el 5 de Abril de este año en la revista Mycological Progress.

Abstract (traducido)

Cortinarius (Fr.) Fr. es uno de los géneros más ricos en especies de los Agaricales (Basidiomycota). Subgénero Cortinarius. Dermocybe (Fr.) Trog incluye Cortinarii de colores brillantes con pigmentos de antraquinona. El enfoque quimiotaxonómico siempre ha sido tan importante como los métodos clásicos para la definición de especies de Dermocybe y ayudó a mejorar los conceptos generales de especies. Sin embargo, algunos conceptos de especies dentro de este grupo siguen sin estar claros. Por lo tanto, abordamos este tema basándonos en un enfoque combinado filogenético, morfológico y químico de pigmentos. Para ello, se incluyeron datos de secuencia, perfiles de pigmentos HPLC-MS y tamaños de esporas para obtener una mejor resolución de los taxones. El estudio se basó en 173 colecciones recientes y 12 especímenes tipo. Se produjeron un total de 117 secuencias ITS de ADNr a partir de las colecciones de este estudio y se recuperaron 102 secuencias de bases de datos. Pudimos detectar y delimitar claramente 19 especies de Dermocybe que se encuentran en hábitats de Europa central, de las cuales 16 se analizan en detalle. Además, agrupamos los pigmentos de antraquinona detectados en cuatro grupos. Este análisis detallado de las especies dermocyboid Cortinarius que se encuentran en un número restringido de tipos de hábitat confirmó nuestra hipótesis de que la diversidad de especies es mucho mayor de lo que se supone actualmente. Esta alta diversidad se ve desdibujada por conceptos de especie demasiado amplios e incorrectos de varias especies clásicas como C. croceus y C. cinnamomeus. Los estudios moleculares y quimiotaxonómicos realizados junto con cuidadosos análisis fenotípicos dieron como resultado una buena diferenciación de especies. Se presenta una clave para estos taxones que permita una mejor identificación de Cortinarius subgénero Dermocybe spp. en Europa Central principalmente en la cordillera alpina.

Enlace (dar download pdf)

https://link.springer.com/article/10.1007/s11557-024-01959-z

Cortinarius subgenus Leprocybe in Europe: expanded Sanger and Next Generation Sequencing unveil unexpected diversity in the Mediterranean

Trabajo realizado por A. Bidaud , M. Loizides , F. Armada , J. de Dios Reyes , X. Carteret , G. Corriol , Consiglio , P. Reumaux , J.-M. Bellanger , y publicado en la revista Persoonia 46, 2021: 188–215 (inglés)

Abstract (Resumen):

Las filogenias moleculares de la última década han demostrado que la diversidad descrita de Cortinarius todavía está subestimada, especialmente fuera de las ecorregiones continentales y boreales donde el género ha sido investigado históricamente. Abordamos este problema revisando el subgénero Leprocybe, hasta ahora no resuelto, y nos centramos en el punto crítico de biodiversidad del Mediterráneo, en gran parte inexplorado. La secuenciación y el análisis filogenético de 161 colecciones comprobadas de Austria, Chipre, Francia, Alemania, Italia y España, incluidos 16 tipos, permitieron delimitar 11 especies de este linaje, tres de ellas reconocidas como nuevas para la ciencia e introducidas formalmente como C. jimenezianus, C. selinolens y C. viridans spp. noviembre, respectivamente. Curiosamente, las especies recientemente descritas exhiben una distribución mediterránea estricta, y una de ellas es supuestamente endémica de la isla de Chipre, lo que destaca el notable potencial de esta ecorregión olvidada para descubrir una mayor diversidad no descrita de Cortinarius en el futuro. El presente trabajo también revela 23 sinonimias en este subgénero, así como un cripticismo no detectado previamente dentro de C. venetus. La secuenciación de próxima generación realizada en tres holotipos antiguos y contaminados descifra con éxito su identidad filogenética, incluida la de C. leproleptopus, zanjando finalmente la larga controversia sobre el estado taxonómico de esta especie. Por último, se proporciona una breve descripción de cada especie del subgénero y se propone una clave para facilitar la identificación de los taxones europeos de Leprocybe actualmente conocidos en el campo.

https://www.ingentaconnect.com/contentone/nhn/pimj/2021/00000046/00000001/art00007

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The genus Gautieria (Gomphales) in Europe and the Mediterranean Basin: a morphological and phylogenetic taxonomic revision

Abstract (Resumen)

Se han estudiado material tipo y colecciones adicionales de 11 taxones de Gautieria descritos en Europa y el norte de África, a saber, G. dubia, G. graveolens, G. morchelliformis var. globispora, G. morchelliformis var. magnicellaris, G. morchelliformis var. morchelliformis, G. morchelliformis var. stenospora, G. otthii, G. pseudovestita, G. retirugosa, G. trabutii y G. villosa. Paralelamente se han llevado a cabo estudios morfológicos y genéticos sobre colecciones recientes y de herbario de varios países europeos. Esto permitió aclarar secciones dentro de Gautieria y diferenciar 28 taxones, de los cuales 21 son nuevos para la ciencia. Sin embargo, las relaciones más profundas y los cambios de nomenclatura relacionados con la posición filogenética del género Gautieria dentro de Gomphaceae no se abordarán en este estudio porque requerirían un análisis molecular más completo junto con el de géneros relacionados, por ejemplo, Gomphus, Turbinellus y cuatro subgéneros de Ramaria. Además, se ha elaborado un lectotipo para G. villosa var. villosa y especímenes de referencia para G. graveolens y G. morchelliformis var. morchelliformis, y la nueva combinación G. morchelliformis var. Se propone dubia. Se proporcionan descripciones detalladas, macro y microfotografías y mapas de distribución de todos los taxones, así como amplia información sobre su ecología, corología y filogenia. Se incluye una clave para facilitar la identificación de taxones.

May 2023. Persoonia – Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi 50:48–122

Trabajo en inglés, en este pdf (cliquear en download article):

https://www.ingentaconnect.com/content/nhn/pimj/2023/00000050/00000001/art00003;jsessionid=750sso6cc3i1p.x-ic-live-03

The Paxillus involutus (Boletales, Paxillaceae) complex in Europe: genetic diversity and morphological description of the new species Paxillus cuprinus, typification of P. involutus s.s., and synthesis of species boundaries.

Abstract/Resumen (publicado en 2014)

Paxillus involutus es una especie modelo para estudios ecológicos o fisiológicos de agaricomicetos ectomicorrícicos. Se han distinguido ecológica y morfológicamente de tres a seis grupos o especies vinculadas a él. Estudios filogenéticos han revelado la existencia de cuatro especies en Europa: Paxillus ammoniavirescens, Paxillus obscurisporus, P. involutus y una cuarta especie aún no descrita. Estudiamos 47 colecciones de 24 localidades francesas e italianas, complementadas con datos del GenBank, para delimitar genética y taxonómicamente estas especies. Los análisis filogenéticos de tres regiones del ADN nuclear (espaciador transcrito interno de ADNr (ITS), tef1-α y gpd) confirmaron las cuatro especies europeas. Las características morfológicas, culturales y ecológicas nos permitieron delinear los límites de las especies y describir la cuarta especie a la que llamamos Paxillus cuprinus ya que se vuelve cobriza con la edad. Como no existe ningún espécimen de herbario original de P. involutus, se eligió una de nuestras colecciones como epitipo. La baja diversidad genética encontrada en P. cuprinus se correlaciona con rasgos morfológicos estables (color del basidioma, esporas ovoides-amigdaliformes con constricción apical) y con preferencias ecológicas (asociación con Betulaceae en áreas abiertas y templadas). Por el contrario, P. ammoniavirescens se caracteriza por una alta diversidad genética y una alta variación de sus características morfológicas y ecológicas.

Trabajo completo en este pdf (inglés):

https://iris.unito.it/bitstream/2318/152679/1/Paxillus%20involutus_4aperto.pdf

Claves del complejo involutus de los taxones europeos en francés (2018) (Jean Paul Chaumeton):

https://shnvc.e-monsite.com/medias/files/paxillus-cle-jean-paul-chaumeton-03-2018.pdf